Molekulární modelování simulace

Osnova témat

• Úvod
  

  Úvod

  Toto jsou staré verze přednášek a dalších materiálů!

  Používejte nové verze na adrese https://nanoed.tul.cz/course/view.php?id=56 (a to včetně českých skript).

  • Novinky Fórum
• Téma 1
  

  Téma 1

  • Platí pro akademický rok 2011-2012

    Spuštění software MACSIMUS v učebně C4. 

    1. zapnout terminál a přihlásit se účtem do LIANE
    2. klepnout na ikonu Vzdálená plocha
    3. spustit emulátor Cygwin a do konzole zadat startx -- :?
       místo ? zadejte nějaké unikátní číslo od 0 do 15, před a za dvojicí pomlček je mezera, dvojtečka je povinná.
    4. v terminálu pak setxkbmap us nastaví US klávesnici
    5. pomocí mc lze spustit Midnight Commander a procházet složky. Macsimus je v /cygdrive/c/macsimus/bin
• Téma 2
  

  Téma 2

  • Statistická termodynamika Soubor
• Téma 3
  

  Téma 3

  • Modely Soubor
• Téma 4
  

  Téma 4

  • Molekulová dynamika - Verletova metoda Soubor
• Téma 5
  

  Téma 5

  • Gearovy metody, teplota v MD Soubor
• Téma 6
  

  Téma 6

  • Metody Monte Carlo Soubor
  • Monte Carlo methods Soubor 175KB
• Téma 7
  

  Téma 7

  Platí pro akademický rok 2011-2012

  • Simulační praktikum: bod tání modelu NaCl Soubor
• Téma 8
  

  Téma 8

  • Metodika simulace Soubor 492.6KB
• Téma 9
  

  Téma 9

  • Další metody Soubor 456.5KB
• Téma 10
  

  Téma 10

  • Kinetické vlastnosti Soubor 260KB